Медицинская карта
Плохой врач лечит болезнь, хороший - причину болезни.
  • гепатит
  • Недели беременности

    Беременность по неделям

  • Сколько живут с диагнозом рак
  • Как рыбий жир может уменьшить воспаление

Исследование генома обнаружило неожиданную вариацию в фундаментальном гене РНК

2022-02-15 15:31:03

Исследование генома, предпринятое исследователями онкологического центра Киммела Джона Хопкинса для поиска вариантов в гене, считающемся фундаментальным строительным блоком для микроскопических структур, синтезирующих белки, приняло неожиданный оборот.


Гены человеческой рибосомной РНК (рРНК) необходимы для построения рибосом или механизмов, транслирующих белки. Результаты исследования, которые будут опубликованы в выпуске журнала RNA от 2 февраля , продемонстрировали, что эти гены , которые считались одинаковыми у людей, вместо этого значительно различались в зависимости от географического происхождения человека. Особенно высокие вариации были обнаружены в сегменте, называемом 28S рРНК, важном компоненте рибосомы, транслирующей белок.


Команда, возглавляемая Марикки Лайхо, доктором медицинских наук, директором отдела молекулярных радиационных наук в Департаменте радиационной онкологии и молекулярных радиационных наук, отклонилась от своей обычной исследовательской направленности на разработку новых молекул, которые могли бы быть потенциально полезными при лечении рака. рака , чтобы углубиться в основную концепцию биологии, которую они хотели лучше понять.


Они разработали противораковые препараты , нацеленные на синтез рибосомных рРНК — уникальный процесс, приводящий к развитию рака. Без них раковые клетки не могут размножаться. Команда задалась вопросом, изменяется ли сам ген рРНК при раке и как это может повлиять на их стратегию нацеливания. Несмотря на важность этого гена, до настоящего времени не было опубликовано окончательной эталонной последовательности.


Члены команды решили применить биоинформатический подход к последовательностям генов рРНК, используя высокопроизводительные компьютеры в Вычислительном центре перспективных исследований Мэриленда, совместном предприятии, управляемом Университетом Джона Хопкинса и Университетом Мэриленда. Чтобы начать картировать изменения рака, им нужно было понять, существуют ли варианты в человеческой популяции. Последовательность гена рРНК считалась «неприкасаемой» или настолько фундаментальной, что маловероятно, чтобы она имела какие-либо вариации.


«Однако, когда мы начали этот анализ, мы очень быстро поняли, что раковые геномы сильно аберрантны», — говорит Лайхо. «Для того, чтобы мы могли понять, реальна ли эта аберрация — то есть, что она изменяется при конкретном раке, — нам нужно было лучше понять, как выглядит нормальный человеческий ген».


Затем они использовали данные секвенирования всего генома из проекта 1000 Genomes (международная база данных генетики человека) для анализа вариантов у 2504 человек из 26 популяций. Они идентифицировали 3791 вариантное положение гена рРНК. Это включало 470 вариантов положений, наблюдаемых на 28S рРНК. Большинство этих вариантов были расположены на длинных выступающих складках рРНК, которые различаются у разных видов. Они представляют позиции разнообразия и потенциально находятся в процессе непрерывной эволюции.

Оставьте комментарии и отзывы!

Используйте нормальные имена. Ваш комментарий будет опубликован после проверки.

(обязательно)