Проточная цитометрия — это мощная и сложная технология, используемая для подсчета, сортировки или измерения характеристик клеток и обнаружения биомаркеров. Он также широко используется в исследованиях, а также в клинических исследованиях и диагностике таких заболеваний, как рак крови. Однако для проточной цитометрии требуются интактные и, как правило, свежие клетки, которые необходимо быстро обработать, чтобы сохранить целостность клеток и поверхностные маркеры. Эти поверхностные (и некоторые ядерные) маркеры используются для идентификации типов иммунных клеток.
Исследователи из Дартмутского и Дартмутско-Хичкоковского онкологического центра Норриса Коттона (NCCC) в сотрудничестве со Школой общественного здравоохранения Университета Брауна, Калифорнийским университетом в Сан-Франциско (UCSF) и Медицинским центром Канзасского университета (KUMC) представили новый иммунный - метод профилирования, способный сообщать о конкретных типах иммунных клеток, используя только ДНК из крови, а не из свежих образцов клеток. Их метод «Расширенная деконволюция клеток периферической крови с использованием метилирования ДНК для иммунного профилирования с высоким разрешением» недавно опубликован в Nature Communications .
«Наша технология требует минимальных затрат для использования образцов ДНК крови, хранящихся в различных условиях», — говорит ведущий автор Лукас А. Салас, доктор медицины, магистр здравоохранения, доктор философии, член Программы исследований популяционного рака (CPS) NCCC и доцент эпидемиологии. в Медицинской школе Гейзеля в Дартмуте. «Это идеально подходит для популяционных эпидемиологических исследований и, возможно, для клинических условий, где образцы не могут быть обработаны немедленно».
«В нашей статье подробно описывается новый метод, который предлагает мощную альтернативу традиционной проточной цитометрии, основанную на ДНК крови, а не на интактных живых клетках », — добавляет соавтор Джон Винке из Института генетики человека UCSF.
Новый подход дает возможность задавать вопросы об иммунной системе в норме и при болезнях и отвечать на них, используя миллионы образцов крови, хранящихся в биобанках США и всего мира — образцы, которые уже существуют по другим причинам. В клинических условиях дифференциальный полный анализ крови (CBC) обычно используется для диагностики состояния пациента и ограничивается пятью общими типами иммунных клеток. В новом методе идентификация иммунных клеток расширена за счет включения двенадцати типов иммунных клеток , в том числе нескольких, которые не определяются с помощью общего анализа крови, таких как наивные Т- и В-клетки памяти.
