Международная группа ученых во главе с Бристольским университетом обнаружила карман с лекарствами в белке SARS-CoV-2 Spike, который можно использовать для предотвращения заражения вирусом человеческих клеток. Исследователи говорят, что их результаты, опубликованные сегодня в журнале Science , потенциально могут изменить правила игры в борьбе с текущей пандемией, и добавляют, что маломолекулярные противовирусные препараты, разработанные для нацеливания на обнаруженный ими карман, могут помочь устранить COVID-19.
SARS-CoV-2 украшен множеством копий гликопротеина, известного как «белок Spike», который играет важную роль в вирусной инфекционности. Спайк связывается с поверхностью клетки человека, позволяя вирусу проникнуть в клетки и начать репликацию, вызывая обширные повреждения.
В этом новаторском исследовании команда, возглавляемая профессором Кристиан Шаффицель из Бристольской школы биохимии и профессором Имре Бергером из Центра минимальной биологии Макса Планка-Бристоля, использовала мощный метод визуализации - электронную крио-микроскопию (крио-ЭМ). для анализа SARS-CoV-2 Spike с разрешением, близким к атомному. Благодаря высокопроизводительным облачным вычислениям Oracle была сгенерирована трехмерная структура белка SARS CoV-2 Spike, что позволило исследователям заглянуть глубоко внутрь Spike и определить его молекулярный состав.
Неожиданно анализ исследовательской группы выявил присутствие небольшой молекулы линолевой кислоты (LA), скрытой в специально подобранном кармане внутри белка Spike. LA - это свободная жирная кислота, которая необходима для многих клеточных функций. Человеческое тело не может производить LA. Вместо этого организм поглощает эту важную молекулу с пищей. Интересно, что LA играет жизненно важную роль в воспалении и иммунной модуляции, которые являются ключевыми элементами прогрессирования заболевания COVID-19. LA также необходим для поддержания клеточных мембран в легких, чтобы мы могли правильно дышать.