Новое исследование, проведенное учеными из онкологического центра доктора медицины Андерсона Техасского университета, обнаружило, что мутации, обнаруживаемые при раке, не накапливаются случайным образом, а обнаруживаются в различных паттернах, которые различаются в зависимости от трехмерной организации генома в клетке, а также основные факторы, вызывающие мутации.
Мутации, вызванные внешними факторами, такими как ультрафиолетовый свет или табачный дым, привели к мутациям в регионах, отличных от внутренних факторов, таких как дефекты в восстановлении повреждений ДНК или в механизмах корректуры. Результаты, опубликованные сегодня в Nature Genetics , важны для понимания того, какие факторы могут вызывать мутации в данном раке, и могут указывать на новые терапевтические цели.
«ДНК не организована случайным образом в ядре, и мы обнаружили, что эта структура сильно коррелирует с тем, как раковые клетки накапливают мутации», - сказал ведущий автор Кадир Акдемир, доктор философии, преподаватель геномной медицины. «Мы знаем, что существуют определенные процессы, вызывающие мутации в раковых клетках, но мы не всегда понимаем их первопричины. Эти результаты должны дать нам ключ к пониманию того, как рак накапливает мутации, и, возможно, мы сможем нацелить и убить раковые клетки , используя мутации, которые они накапливают ".
В ядре клетки ДНК упакована с белками в хроматин, высокоорганизованную и компактную структуру, из которой состоят наши хромосомы. В рамках этой структуры гены, которые часто используются в клетках, организованы вместе в «активные домены», которые более доступны. Те гены, которые используются реже, аналогичным образом организованы вместе в «неактивные домены».
Исследователи проанализировали, распространяются ли мутации чаще в этих активных или неактивных доменах при раке, изучив общедоступные данные полногеномного секвенирования 3000 парных образцов нормальной ткани и опухолевой ткани по 42 типам рака.
